На сайте МФТИ я прочитал, что экзамены, сдаваемые в июле являются финальными; на сегодня у меня хорошая оценка по физике, и не совсем по математике, могу ли я в июле сдавать только математику, а физику засчитать себе с квалификационыых олимпиад? А в случае, если напишу математику хуже чем есть (лотерея, сами понимаете) могу ли я засчитать себе старую оценку в качестве экзамена по математике?

но тогда весенние результаты по математике пропадут, т.е. на сколько напишешь, столько и получишь.

У меня 21 балл(12м-9ф). Могу ли зачесть эти баллы, и вообще не писать июльский экзамен?

Конечно можешь! У меня наподобие. За Московскую областную 22 (12 физика, 10 математика). с 22 июня приходишь, и говоришь, что хочешь зачесть свои баллы.

Да. Вы можете зачесть один предмет с олимпиады, а второй сдавать на вступительных экзаменах, но оценка на вступительных является окончательной, при неблагоприятном исходе зачесть старую с олимпиады Вы уже не сможете.

Да можете, Вам останется пройти лишь собеседование факультетское и по русскому языку. Но документы Вы обязаны подать С 22 по 30 июня до 17.00.